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甲基化dna的解析

基于corba法的胚胎干细胞及脑、肝脏中nanog、hnf4a基因的dna甲基化解析

虽然没有碱基序列的变化,但细胞分裂后继承的基因功能仍发生变化的现象作为表观遗传学而为人所知。正逐渐明确了在癌等诸多疾病中,基因的表观遗传学异常与病态相关。

作为表观遗传学基因控制之一的甲基化dna可望在病态诊断、再生医疗等中用作筛选es细胞或ips细胞的生物标记物。

这是基于corba法的在es细胞及脑,肝脏中nanoghnf4a基因的dna甲基化解析例。使用dna/rna分析用微芯片电泳装置进行测定。

*corba:combined bisulfite restriction analysis

         

凝胶图与电泳图

可知对于维持es细胞多能性而言非常重要的nanog基因在es细胞中低甲基化,在脑中高甲基化,与肝脏特异性基因表达相关的hnf4a基因在肝脏中低甲基化,在脑中高甲基化。

*数据提供:东京大学大学院农学生命科学研究所 教授盐田邦郎先生

dna甲基化解析还有亚硫酸氢盐测序等若干分析方法,但本法低成本、高通量,可有效应用于测序样品的选择与筛选。

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